i2c_rtc_rx8025驱动总结-飞外

ARM : at91-sam9x5ek Linux内核：linux-2.6.39 时钟芯片：rx8025 SA/NB

第一种方法：

Rx8025驱动程序在该linux内核中已经包含，路径为：drivers/rtc/rtc-rx8025.c 所以在内核中增加驱动只需要配置即可：

1. 执行make ARCH=arm menuconfig 进入菜单选项，选择RTC配置，选中EPSON RX-8025SA/NB，同时一定要去掉cpu自带的时钟。

2. i2c support 需要选中I2C Hardware Bus support中GPIO-based bitbanging I2C，否则，即使rtc驱动正确，也不能使用，提示：drivers/rtc/hctosys.c: unable to open rtc device (rtc0)。问题源自，驱动配置正确，I2C驱动没有加载正确，udevd不能创建rtc0设备节点

3. 在arch/arm/mach-at91/board-sam9x5ek.c中添加信息，注意此处的name名称要与驱动程序中id_table中的名称保持一致。

而在linux某些匹配机制中，设备名称是与驱动名称相一致。 如果名称不能正确匹配，系统是不会执行probe函数的。

另外需要注意的是i2c地址，手册上给出的地址一般都是带有读写位的，而程序中的地址需要把最后一位的读写位去掉，取前面的7位。Rx8025的地址为0x64，相应的程序中的地址应该为0x32。否则会提示对寄存器的操作失败。

4. 驱动正确配置后，生成相应的文件 /dev/i2c-0 /dev/rtc0 /sys/bus/i2c/drivers/rtc-rx8025 /sys/bus/i2c/drivers/0-0032

嵌入式Linux系统下I2C设备驱动程序的开发

【摘 要】 I2C总线是一种很通用的总线，具有简单、高效等特点，广泛应用在各种消费类电子产品及音视频设备上，在嵌入式系统的开发中也经常用到。本文分析了嵌入式 linux系统中I2C驱动程序的结构，并结合一个具体的I2C时钟芯片DS1307，说明在嵌入式linux系统下开发I2C设备驱动程序的一般流程。 【关键字】I2C总线 嵌入式linux 驱动开发

1、I2C总线简介 I2C (Inter-Integrated Circuit)总线是一种由PHILIPS公司开发的两线式串行总线，用于连接微控制器及其外围设备。I2C总线最主要的优点就是简单性和有效性。

1.1 I2C总线工作原理

I2C总线是由数据线SDA和时钟SCL构成的串行总线，各种被控制器件均并联在这条总线上，每个器件都有一个唯一的地址识别，可以作为总线上的一个发送器件或接收器件(具体由器件的功能决定) [1]。I2C总线的接口电路结构如图1所示。

图1 I2C总线接口电路[1] 1.2 I2C总线的几种信号状态[1]

1. 空闲状态：SDA和SCL都为高电平。 2. 开始条件(S)：SCL为高电平时，SDA由高电平向低电平跳变，开始传送数据。 3. 结束条件(P)：SCL为低电平时，SDA 由低电平向高电平跳变，结束传送数据。

4. 数据有效：在SCL的高电平期间， SDA保持稳定，数据有效。SDA的改变只能发生在SCL的底电平期间。

5. ACK信号: 数据传输的过程中，接收器件每接收一个字节数据要产生一个ACK信号，向发送器件发出特定的低电平脉冲，表示已经收到数据。 1.3 I2C总线基本操作

I2C总线必须由主器件（通常为微控制器）控制，主器件产生串行时钟（SCL），同时控制总线的传输方向，并产生开始和停止条件。

数据传输中，首先主器件产生开始条件，随后是器件的控制字节（前七位是从器件的地址，最后一位为读写位 ）。接下来是读写操作的数据，以及 ACK响应信号。数据传输结束时，主器件产生停止条件[1]。具体的过程如图2所示。

图2 完整的I2C数据传输过程[1] 2 . Linux下I2C驱动程序的分析 2.1 Linux系统I2C驱动的层次结构

Linux系统对I2C设备具有很好的支持，Linux系统下的I2C驱动程序从逻辑上可以分为3个部分：

1. I2C总线的驱动 I2C core ：实现对I2C总线、I2C adapter及I2C driver的管理。 2. I2C控制器的驱动 I2C adapter ：针对不同类型的I2C控制器 ，实现对I2C总线访问的具体方法。

3. I2C设备的驱动 I2C driver ：针对特定的I2C设备，实现具体的功能，包括read, write以及ioctl等对用户层操作的接口。 这三个部分的层次关系如图3和图4所示。

2.2 I2C 总线驱动 I2C core

I2C core是Linux内核用来维护和管理的I2C的核心部分，其中维护了两个静态的List，分别记录系统中的I2C driver结构和I2C adapter结构。I2C core提供接口函数，允许一个I2C adatper，I2C driver和I2C client初始化时在I2C core中进行注册，以及退出时进行注销。同时还提供了I2C总线读写访问的一般接口（具体的实现在与I2C控制器相关的I2C adapter中实现），主要应用在I2C设备驱动中。

2.3 I2C控制器的驱动 I2C adapter

I2C adapter是针对不同类型I2C控制器硬件，实现比较底层的对I2C总线访问的具体方法。I2C adapter 构造一个对I2C core层接口的数据结构，并通过接口函数向I2C core注册一个控制器。 I2C adapter主要实现对I2C总线访问的算法，iic_xfer() 函数就是I2C adapter底层对I2C总线读写方法的实现。同时I2C adpter 中还实现了对I2C控制器中断的处理函数。

2.4 I2C设备的驱动 I2C driver

I2C driver中提供了一个通用的I2C设备的驱动程序，实现了字符类型设备的访问接口，对设备的具体访问是通过I2C adapter来实现的。I2C driver构造一个对I2C core层接口的数据结构，通过接口函数向 I2C Core注册一个I2C设备驱动。同时I2C driver 构造一个对用户层接口的数据结构，并通过接口函数向内核注册为一个主设备号为89的字符类型设备。

I2C driver实现用户层对I2C设备的访问，包括open，read，write，ioctl，release等常规文件操作，我们可以通过open函数 打开 I2C的设备文件，通过ioctl函数设定要访问从设备的地址，然后就可以通过 read和write函数完成对I2C设备的读写操作。

通过I2C driver提供的通用方法可以访问任何一个I2C的设备，但是其中实现的read，write及ioctl等功能完全是基于一般设备的实现，所有的操作 数据都是基于字节流，没有明确的格式和意义。为了更方便和有效地使用I2C设备，我们可以为一个具体的I2C设备开发特定的I2C设备驱动程序，在驱动中 完成对特定的数据格式的解释以及实现一些专用的功能。 3. 一个具体的I2C设备驱动程序的开发

DS1307是一款小巧的I2C接口的实时时钟芯片，具有低功耗，全BCD码时钟和日历输出， 12 /24小时工作模式，时分秒、星期、年月日计时数据，润年自动补偿，有效期至2100年，外加56 Bytes的NV RAM（非易失性的RAM）等特点[3]。下面以DS1307为例，说明一个具体的I2C设备驱动程序的设计要点。 3.1 I2C设备驱动程序的一般结构

一个具体的I2C设备驱动需要实现两个方面的接口，一个是对I2C core层的接口，用以挂接I2C adapter层来实现对I2C总线及I2C设备具体的访问方法，包括要实现attach_adapter，detach_client，command 等接口函数。另一个是对用户应用层的接口，提供用户程序访问I2C设备的接口，包括实现open，release，read，write以及最重要的 ioctl等标准文件操作的接口函数。 对I2C core层的接口函数的具体功能解释如下： attach_adapter：I2C driver在调用I2C_add_driver() 注册时，对发现的每一个I2C adapter（对应一条I2C 总线）都要调用该函数，检查该I2C adapter是否符合I2C driver的特定条件，如果符合条件则连接此I2C adapter，并通过I2C adapter来实现对I2C总线及I2C设备的访问。

detach_client：I2C driver在删除一个I2C device时调用该函数，清除描述这个I2C device的数据结构，这样以后就不能访问该设备了。

command：针对设备的特点，实现一系列的子功能，是用户接口中的ioctl功能的底层实现。

3.2 DS1307驱动程序实现对I2C core层的接口

在驱动中必须实现一个struct i2c_driver 的数据结构，并在驱动模块初始化时向I2C core注册一个I2C驱动，并完成对I2C adapter的相关操作。 struct i2c_driver ds1307_driver = { name: "DS1307", id: I2C_DRIVERID_DS1307, flags: I2C_DF_NOTIFY, attach_adapter:ds1307_probe, detach_client:ds1307_detach, command: ds1307_command }; 数据结构ds1307_driver中的name:"DS1307"，Id:I2C_DRIVERID_DS1307用来标识DS1307驱动程序。flags: I2C_DF_NOTIFY表示在I2C总线发生变化时通知该驱动。

ds1307_probe对应i2c_driver数据结构中的attach_adapter，主要功能：调用 I2C core 层提供的i2c_probe函数查找一条I2C总线，看是否有DS1307的设备存在，如果存在DS1307，则将对应的I2C adapter 和DS1307设备挂接在一起，并通过该I2C adapter来实现对DS1307的访问。同时使能DS1307, 并调用i2c_attach_client()向I2C core层注册DS1307。

ds1307_detach对应i2c_driver数据结构中的detach_client，主要功能：调用i2c_detach_client() 向I2C core层注销DS1307，并不使能DS1307，这样I2C驱动就不能访问DS1307了。

ds1307_command对应i2c_driver 数据结构中的command ，主要功能：针对DS1307时钟芯片的特点，实现一系列的诸如DS1307_GETTIME ，DS1307_SETTIME，DS1307_GETDATETIME，DS1307_MEM_READ，DS1307_MEM_WRITE等子功能， 是用户接口中的ioctl功能的底层实现。

以上3个接口函数使DS1307的驱动程序实现了对I2C 总线及I2C adpater的挂接，因此就可以通过I2C core的提供对I2C总线读写访问的通用接口，来开发实现DS1037驱动程序对用户应用层的接口函数。 3.3 DS1307驱动程序实现对用户应用层的接口

在驱动中必须实现一个struct file_operations 的数据结构，并向内核注册为一个字符类型的设备（用单独的主设备号来标识），或者注册为一个miscdevice设备（所有miscdevice设备共同 一个主设备号，不同的次设备号，所有的miscdevice设备形成一个链表，对设备访问时根据次设备号查找对应的miscdevice设备，然后调用其 struct file_operations中注册的应用层接口进行操作）。

struct file_operations rtc_fop(xl码适合多高体重多重的人？男士XL码适合人群∶身高范围:175-180cm;体重范围:65-75公斤;如果是标准身材，建议身高175cm，体重70公斤的人穿比较合身。女士XL码适合人群∶身高范围:164-167cm 体重范围:56-62公斤;如果是标准身材，建议身高165cm，体重55公斤的人穿比较合身。)s = { owner: THIS_MODULE, ioctl: ds1307_rtc_ioctl, read: ds1307_rtc_read, write: ds1307_rtc_read, open: ds1307_rtc_open, release: ds1307_rtc_release }; 数据结构rtc_fops 中的ds1307_rtc_open 和ds1307_rtc_release对应file_operations中的open和release，分别用来打开和关闭DS1307。 ds1307_rtc_ioctl对应file_operations中的ioctl，对用户提供的一系列控制时钟芯片的具体命 令：RTC_GET_TIME： 以固定的数据格式读取实时时钟的时间。RTC_SET_TIME：以固定的数据格式设定实时时钟的时间。RTC_SYNC_TIME：系统时钟和实时时钟 之间的时间同步。

ds1307_rtc_read 对应对应file_operations中的read，实现与ds1307_rtc_ioctl 的子功能RTC_GET_TIME相同的功能，以及从NV RAM读取数据。

ds1307_rtc_write 对应file_operations中的write，实现与ds1307_rtc_ioctl的子功能 RTC_SET_TIME相同的功能，以及将数据写入NV RAM。 3.4 DS1307驱动程序的加载和测试

在DS1307驱动模块的初始化函数ds1307_init()中，首先通过i2c_add_driver(&ds1307_driver) 向I2C core层注册一个I2C的设备驱动，然后再通过misc_register (&ds1307_rtc_miscdev)将DS1307注册为一个miscdevice设备，这样用户程序就可以通过主设备号10 次设备号 135的设备节点/dev/rtc来访问DS1307了。

将DS1307的驱动程序编译成模块的方式，通过insmod命令加载进内核，然后用测试代码进行测试，DS1307驱动程序中实现的所有功能都达到了预期的效果。 由于DS1307驱动程序在底层实现了对DS1307时钟芯片数据的解释和转换，所以在用户程序中得到的就是有固定格式和意义的数据，这样就方便了用户程序的访问，提高了应用开发的效率。 4．总结

I2C总线是一种结构小巧，协议简单的总线，应用很广泛，访问起来简单方便。linux系统下I2C的驱动程序具有清晰的层次结构，可以很容易地为一个特 定的I2C设备开发驱动。本文通过对linux系统下I2C驱动，以及一个具体的DS1307时钟芯片驱动结构的分析，基本上可以很清楚看出一个I2C设 备驱动的开发过程。实现的关键分为两个部分，1. 对I2C core的接口，必须实现 struct i2c_drvier 数据结构中的几个特定的功能函数。这些函数是I2C驱动与I2C总线物理层（I2C控制器）和I2C设备器件之间通信的基础。2. 对用户应用层的接口，必须实现struct file_operation数据结构中的一些特定功能的函数，如 open ，release , read ,write，lseek等函数。以上两类接口中，对I2C core的接口是对I2C设备访问的基础，实现对I2C总线具体的访问方法；对用户应用层的接口则是方便应用程序开发，实现设备特定功能的必不可少的部 分。 参考文献：

[1] Philips Corporation，I2C bus specification version 2.1，2000 [2] Linux kernel，version 2.4.30 [3] Maxim Integrated Products , inc . USA . DS1307 Datasheet , 2004 [4] Aless and Robin著，魏永明等译，《LINUX设备驱动程序（第二版）》，北京，中国电力出版社，2004年

三、 I 2 C总线控制技术

I 2 C总线即Inter Integrated-circuit Bus，由数据线

(SDA)，时钟线(SCL)构成的串行总线结构，在CPU与IC 之间进

行数据的双向传送。I 2 C 总线最初由荷兰飞利浦公司研究开发，

用于仪器、仪表电路上，现已广泛应用在彩色电视机等家电产品

中，作为IC器件间的控制核心。

1． I 2 C 总线的基本概念

随着大屏幕彩电遥控功能的增加， 需要控制的项目也越来越

多。如果采用传统的彩色电视机的功能控制模式，对应于每一种

控制量，微处理器芯片上都有一个相应的引脚，那么势必增加

CPU 的引脚、 接口电路和集成电路外围的元器件。 而采用 I 2 C 总

线系统，在微处理和被控集成电路之间连接两条线，一条用来传

8 输控制信息的串行数据总线 (SDA)， 一条用来传输时钟信息的时

钟总线 (SCL)， 大屏幕彩电的所有功能控制均可以通过这两条总

线的控制来实现。如此采用 I 2 C 总线的遥控系统， CPU 只要

用两个接口就可以完成如模拟量、状态转换、频段选择等诸多功

能的控制，由此可省去微处理器的许多引脚，简化集成块外围电

路。

CPU 电路是 I 2 C 总线系统的核心。彩电中很多受CPU控制

的集成电路都可以挂接在I 2 C 总线中，CPU 通过I 2 C 总线和

多个被控集成电路连接起来，对这些电路进行控制。I 2 C 总线

上挂接的被控集成电路的功能与通常彩电相同, 但为了通过I 2 C 总线，能与主控CPU进行通信，这些被控IC 内部需要增加I 2 C 总线接口电路，在接口电路中设有数据解码器，以便接收、识

别和处理由主控CPU 发出的控制指令和数据,由于在彩电中使用

的集成电路多为模拟电路,故在接口电路中还应设有数/模变换

器和控制开关。CPU送来的I 2 C 总线数据经解码和D/A变换后

才能对被控集成电路执行控制操作。

I 2 C 总线同时又是一种双向总线系统，CPU 既可以向被控

集成电路发送数据,被控集成电路也可以通过I 2 C 总线向CPU

传送数据， •不过被控集成电路是接收还是发送数据由CPU控制。

正因为I 2 C 是双向总线系统,所以CPU 可以对I 2 C 总线上挂

接的电路进行故障检查。

9 I 2 C 总线是一种串行的数据结构，I 2 C 总线中的微处理

器发出的串行数据中，除各种功能控制指令外，还包括其它内容

的信号如:起始信号和停止信号，前者表示开始传送数据，后者

表示停止传送数据；被控电路地址，用来指定受控集成电路；数

据传送方式，用来指定受控集成电路的工作方式是读出还是写

入。

2． I 2 C 总线控制的基本特点

I 2 C 总线控制技术，引入到大屏幕彩色电视机中，将CPU 为核心的总线系统与电视机中的其它电路相结合,•使电视机具

备如下特点:

（1）用户操作简单、直观 用户对电视机的各项操作均可通过 CPU 总线和受控集成电

路来完成。采用I 2 C 总线控制， 一方面，可以很方便地扩展

大屏幕彩色电视机的控制功能，另一方面，菜单式屏幕显示，使

诸多操作如多画面控制、彩色制式和伴音制式的选择、选台等变

得简单而直观。

（2）维修调整功能

I 2 C 总线控制的彩色电视机，可以对整机的某些参数进行

调整，以往则需要用许多进行这些项目的调整如:高放 AGC的延

迟量、副亮度、场幅度、场线性、行或场中心、枕形校正、白平

衡等, 以往则需要用许多半可调电位器进行这些项目的调整,这

10 不仅增加调试程序，且在使用过程中可靠性较差，电位器常因受

潮锈蚀接触不良，引起电视机的各种故障。而采用I 2 C 总线控

制的彩电，则可以省掉一些半可调电位器，许多项目的调整可由

维修人员进入维修调整状态后, 通过遥控键或本机操作键来完

成。

（3）故障自动检测

由于 I 2 C总线具有数据双向传输功能,因此 CPU可对通信

情况和被控集成电路的工作状态进行检测,通过送回的数据了解

指令完成情况， 并发出新的指令， 向维修人员提供故障自检信息。

（4）方便生产与自动化调整

采用 I 2

C总线控制的电视机因省掉了许多半可调电位器,

不仅简化了调试程序，产品的一致性好，而且在电视机生产过程

中,可在生产线上使用电脑与电视机的I 2 C 总线相连，将最佳的

调整数据存入到电视机的EEPROM 存储器中。这样一来，不但在

产品出厂前，能将电视机的各项功能指标调整到最佳状态，并将

这些数据储存,在电视机使用时，微处理器还能从存储器中读出

这些数据，通过数据总线传送给电视机各被控电路,对电视机进

行调整。

因此，采用 I 2 C 总线系统的彩色电视机中的存储器，除了

存储一般遥控彩电在存储器中所存储的数据外，还有场幅度、场

线性、行或场中心、枕形校正、白平衡等各项最佳状态的数据。 11 所以在更换 I 2 C 总线系统彩色电视机中的存储器时，最好先将

整机调到维修状态， 试试能否将存储器中存有的各项最佳参数数

据调出， 若能， 应将各项参数调出并作好记录， 待更换存储器后，

再将调出的这些最佳状态数据写入存储器中， 以保留整机的各项

最佳状态数据不被破坏。

I2B2总结

摘要：2010 i2b2/VA关于自然语言处理挑战临床记录的研讨会提出了三个任务：一个概念提取任务，从病人报告中提取医学概念；一个断言分类任务，对医学概念分别归类；一个关系分类任务，分配在医疗问题，测试和治疗之间的关系类型。本文先简要介绍三个任务的描述，然后在概念提取、断言分类和关系分类的一般的研究方法上，介绍三个任务对应的主要研究方法。

0 介绍

2010 年 i2b2与盐湖城卫生保健局组织标注了一系列机构的电子病历数据，并且在此基础之上组织了电子病历领域的信息抽取的评测(2010 i2b2/VA challenge)[28].概念抽取被设计为一个信息抽取任务，识别并提取与患者医疗问题(problem)、治疗(treament)和测试(test)相对应的文本。

断言分类，它的目标是把医学概念（模拟为疾病）归类到病人当前患有该疾病(present)，没有该疾病(absent)，可能患有该疾病(possible),病人只在某些情况下才会有该疾病（Conditional），患者可能会发展到该疾病（Hypothetical），该疾病与病人无关（Not associated with the patient）。

关系分类，旨在从一个句子中按照给定参考标准概念对关系分类，分类标准如下： 1.医疗问题与治疗的关系： ▪ TrIP：治疗改善了医疗问题 ▪ TrWP：治疗恶化的医疗问题 ▪ TrCP: 治疗导致医疗问题 ▪ TrAP: 治疗管理医疗问题

▪ TrNAP: 治疗因医疗问题而不被管理 2.医疗问题与测试的关系： ▪ TeRP：测试显示医疗问题

▪ TeCP: 测试进行以调查医疗问题 3.医疗问题与医疗问题的关系： ▪ PIP：医疗问题表明医疗问题

1 注释格式

1.1 概念抽取格式

输入一段病人报告文本，每个概念抽取输出的结果格式如下：

c = “概念文本”偏移 ||t = “概念类型”

其中c表示一个概念的提及。概念文本将替换为报表中的实际文本;偏移量表示跨越概念文本的开始和结束行和单词编号。t表示所提到的概念的语义类型。概念类型被problem、treament或test替换。

例如，c=”chest x‐ray” 6:12 6:13||t=”test” 1.2 概念修饰的格式

每个断言分类的输出，与概念抽取格式相同， 并添加一个断言值, 如下所示: c = "概念文本" 偏移 ||t = "概念类型" ||a = "断言值"

其中c，t同概念抽取，a表示修饰值，断言值被替换为present、absent、possible、Conditional、Hypothetical或associated with someone else|。

例如，c=”diabetes” 2:14 2:14||t=”problem”||a=”absent 1.3 关系分类格式

每个关系分类将在单独的一行上输出，格式如下: c = "概念文本" 偏移 | |r = "关系类型" | |c = "概念文本" 偏移

其中，c同概念抽取，r表示关系类型，关系类型被替换成TrIP、TrWP、TrCP、TrAP、TrNAP、TeRP、TeCP、PIP。

例如，c=”discomfort” 3:4 3:4||r=”PIP”||c=”acute MI” 3:8 3:9。图1显示了患者报告中概念抽取、断言分类和关系分类的参考标准。

图 1 2 评价标准

采用精确率（Precision）、召回率（Recall）以及F1-Measure作为评价指标。真实信息TP、错误信息FP。

Precision(P)TP/(TPFP)

Recall(R)TP/(TPFN) F12PR PR3 主要研究方法

最有效的概念抽取方法是使用条件随机场（CRFs）。最有效的断言分类方法和关系分类方法是使用支持向量机（SVM）。

2Kirk Roberts在2010年i2b2 / VA挑战概念提取方法的结果，排在第九位。使用两个机器学习分类器进行概念提取：用于边界检测的条件随机场（CRF）和用于三维分类概念类型的支持向量机（SVM），并结合自动特征选择方法（贪婪向前特征选择GF、浮动前向/后向选择GFB和遗传算法GA）来找到最好的特征.。由于功能集是自动选择的，所以该方法称为灵活的架构。给定一个新的任务，或者只是新的数据，只要新任务在相同类型的输入上运行，我们就可以自动确定一组新功能。

2针对概念提取，Kirk Roberts等使用正则表达式来识别支持概念提取的九种实体类型，然后用简单的启发式将每个句子分类为散文或非散文；然后，我们使用两个CRF分类器来检测概念边界（开始和结束标记）：一个CRF用于散文句子，另一个CRF用于非散文句子；检测到概念边界后，每个概念分类为问题、治疗或测试。在概念提取之后，预处理排出概要，然后将文档分成不同的部分，并将每个部分与标题相关联，使用不同的特征选择方法进行断

2言分类。由于词汇特征为分类器创造了一个高维问题，Kirk Roberts等开发了统计特征选择，使用点互信息（PMI）和Fisher精确检验。两种方法都基于训练数据中与特定断言类型的问题共同出现的频率，为单词和短语提供评分方法。

Manabu Torii3使用机器学习对来自多个数据源的临床文档进行概念提取，采用BioTagger-GM来训练机器学习标签，继而用2010 i2b2 / VA提供的训练预料进行评估。BioTagger-GM利用基于字典查找功能的机器学习标记器。它利用两大术语资源UMLS和BioThesaurus，使用一组手工编码的规则来纠正机器学习标签的普遍错误。除此之外，BioTagger-GM使用CRF作为基线标记实现MALLET。句子被标记并且用在其上下文中表征标记和标记出现的特征来指定。BioCreative II GM的任务是一个目标类型的基因/蛋白质的概念提取，因此系统被设计为分配一组三个标签{B，I，O}。如上所述，除了广泛使用的用于概念提取的特征（例如，在窗口大小内的附近词语和词性标签），BioTagger-GM还包含字典查找结果。

4 结果

在2010年i2b2 / VA挑战中， Kirk Roberts等采用两种基于ML的方法，并结合自动的特征选择方法，在概念提取中取得好的结果，得分79.52，排名第九。断言分类特征的选取除了贪婪向前（GF）、贪婪向前/向后（GFB），还引入遗传算法（GA）取得最好的分类效果，得分为93.94。并且对各个断言值单独评价，F值介于 43.32和96.17之间。虽然遗传算法没有提供显着的改善（0.1％），但它能够找到几个有用的特征。贪婪的前向/后向算法并没有改善使用原始特征的结果，但是当使用具有统计显着性的n-gram时有显著的效果，但是随着其他特征的增加，新的参数化证明更有效。没有使用GFB，n-gram功能只增加了0.4％，但使用GFB增加到1.1％。因此，自动特征选择和高参数化特征是相辅相成的。

使用2010 i2b2 / VA挑战赛提供的训练语料库，该训练语料库由四个数据集组成：三个来自Beth Israel Deaconess医学中心（BETH），Partners HealthCare（PARTNERS）和匹兹堡大学医学中心（UPMCD）的出院总结以及一个匹兹堡大学医学中心（UPMCP）的一套进度说明。为了概念提取的目的，语料库被标注了三个概念类型：问题，治疗和测试。Manabu Torii3等利用BioTagger-GM进行概念抽取，概念抽取效果在问题、治疗和测试这三种类型上的分

2别是0.8

21、0.806和0.809。在整个概念类型和测试数据集中，基于四个数据集的标注器获得了良好F值，例如，概念问题的BETH为0.787，UPMCP为0.890；并且随着训练数据量的增加，F分数似乎稳步提高，而不是逐渐减少。这个结果表明，随着更多的数据可用，标记性能可能会提高。

参考文献

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共轭效应;

性质：又称离域效应（delocalization effect）。存在于共轭体系中的一种极性（静态）和极化（动态的）现象。是一个分子在“静止”状态以及在微扰状态（例如在反应过程中）的特性。在单双键交替出现的共轭分子中，可以看做两个孤立的双键用一个单键联合在一起，π电子的运动范围由两个碳原子之间扩充到四个碳原子之间，因此称为离域现象。在外界的影响下，共轭效应能使电子分布移并在化学特性上有所反映。例如（1）电性：离域π键的形成增加了物质的电导。（2）颜色：离域π键的形成扩大了π电子的活动范围，使体系能量降低，能级间隔变小，由σ键的紫外光区移至离域π键的可见光区。含离域π键的化合物往往是染料、生色剂和指示剂等。酚酞在碱性溶液中变红就是因为扩大了π电子的离域范围。（3）酸碱性：苯酚呈酸性，苯胺呈碱性。前者是因为电离掉H+后离域范围稳定存在；后者是因为本来分子中就有离域π键，不易电离，可接受H+。（4）化学反应性能：芳香化合物的芳香性、游离基的稳定性，丁二烯类的1,4加成等都和离域π键的生成有关。

共轭效应;conjugation effect

性质：在共轭体系分子中，由于原子间的相互影响和π电子云的离域，引起分子内能降低、体系趋向稳定、键长趋于平均化，以及某些性质的变化等效应，称为共轭效应。产生共轭效应的必要条件是，组成共轭体系的各个原子必须处在同一平面上。这样才能使参加共轭的每个原子的p轨道相互平行而发生侧面重叠。反之，会减弱、甚至使共轭效应完全消失。例如，1,3-丁二烯分子具有共轭效应，而环辛四烯由于组成环的八个碳原子不在同一平面上，因而使共轭效应受到影响。

C效应

定义

效应包括：+c效应、-c效应

通常将共轭体系中给出π电子的原子或原子团所显示的共轭效应称为+c效应,而将吸引π电子的原子或原子团所显示的共轭效应称为-c效应

+C效应;+C effect

性质：在p，π-共轭体系中，与双键相连的X是具有未共享电子对的原子或原子团时，它表现出供电子性能，由它所引起的使共轭体系 的π电子云向双键方向转移，称为+C效应。X为不同原子或原子团时，同族元素的+C效应强弱比较为：-F>-C1>-Br>-I；-OR>-SR>SeR>TeR；-O->-S‑>-Se—>-Te—。同周期元素为：-NR2>-OR>-F

+I效应;+I effect

性质：诱导效应常用符号I表示，比较原子、原子团诱导效应方向时，常以氢原子为标准。若某个原子或原子团的电负性比氢小( i2c_rtc_rx8025驱动总结.doc 将本文档到自己电脑，方便修改和收藏，请勿使用迅雷等。 点此处文档

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